我觉得不应该单纯认为克隆人必须从头再生长一遍，未来也许可以实现制造出完全相同物质的克隆人，从现在开始的3d打印技术入手应该是不错的方向。因为已经有3d打印制造模拟人类器官的案例，当然这些案例一般只是骨骼之类的非生物结构。不妨脑洞大一点，假如我们实现了完全瞬间复制的技术。比如说，一个月的时间，制作出跟本体一模一样物理结构的人。大脑中任何一条沟壑，都精准地一模一样。这样的人是否有所谓的灵魂呢？我觉得答案是肯定的。而且这个灵魂跟本体一模一样。也就是说，被制造出来的一瞬间，他不会接受自己是克隆人这个事实。因为你本身也不会接受。那么自拥有生命那一刻起，他的思想和你的思想就会分道扬镳。他要适应自己作为克隆人的身份，需要发展出全新的三观。这样，你们最终又拥有了不同的灵魂。当然，这里说的灵魂，是由记忆和环境共同决定的。你们相同记忆，却处在截然不同的环境，自然慢慢就会成为不同的灵魂了。其实没有那么玄乎，同卵双胞胎就是这样的情况。他们在出生的那一刻，拥有几乎完全相同的物理结构，但漫长的生长期过后，又成为了不同的人。没有人会觉得其中一个是另一个的复制，也会给两个人两个不同的身份。克隆人也一样，会给他起一个新的名字，让他生活在世界上跟正常人没有区别，没有那么多伦理问题。
那个笛卡尔的“我思故我在”不是“先有思想，后有灵魂”的意思呀...笛卡尔的意思是说：这个我的感知啊有时候骗我，有时候不骗我，可我也不绝对地知道我的感知到底是骗我还是没骗我，所以这世间万物都有可能是假的啊，那可怎么办啊。可是因为有一件事儿我是能确定的啊！因为我在思考，所以我，作为一个有思想的个体，一定是存在的。所以呢笛卡尔的意思是说“我思考”所以证明了“我存在”，不是说因为“我思考”所以“我存在”。这个“我存在”这件事儿吧，笛卡尔觉得，是拜万能的主所赐。至于克隆人嘛...只是生理上相同，但是由于所经历的不一样，所以还是不同的个体呀，所以“灵魂”就放在自己的心里呀。
首先克隆人和普通人的生理，心理等等如果成长环境一样的话是没有任何区别的。想想一下当你还是一个受精卵的时候，把你Ctrl C Ctrl V一下，然后把那个也培养起来就好了。在细胞层面，当初的你们是一样的，这也是克隆的含义。你怎么有“灵魂”，他/她就怎么有。完全不是电影所谓的还要注入之类的。另外关于伦理问题，最大的障碍绝对不是所谓的叫“爸爸”“妈妈”的问题。而是你培育克隆人的目的。参见《逃离克隆岛》，克隆的一大优点就是体器官移植完全不会有排异反应。因此克隆人如果放开，很可能会出现圈养自己的克隆体来供自己移植的恐怖场景。这才是克隆人的伦理挑战。
假设，克隆人依旧需要从单细胞或极少细胞开始发育，而且不与本体共享“灵魂”，那么“灵魂”是否存在于其中的临界点，应该和非克隆体大致相同的，其实也就无异于同卵多胞胎了。假设，直接建立一具肉身，怕是无异于死猪了，毕竟要直接建立一整套复杂、完整的神经系统，还要能正常运转，还要和被克隆的本体一模一样，还要有“灵魂”，怕是直接从其他平行时空拽一个都可能更省力一些吧。所以，克隆本身大概率不影响“灵魂”，毕竟DNA的影响也是极有限的。
克隆改变的只是外在身体灵魂是不变的。举个栗子:本体A 受精卵B 克隆者C正常情况:灵魂进入B，B成长，发展，成为一个正常个体。克隆情况:用A将B变成类似于A的C,灵魂进入C，C成长，发展成为一个个体。所以改变的只有身体。
我猜你想放镜子里